Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KRW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KRW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KRW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KRW8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3KRW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3KRW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3KRW8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3KRW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3KRW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3KRW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KRW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KRW8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3KRW8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KRW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KRW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3KRW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KRW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3KRW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3KRW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3KRW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3KRW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3KRW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
J3KRW8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KRW8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3KRW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
J3KRW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
J3KRW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3KRW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
J3KRW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
J3KRW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
J3KRW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
J3KRW8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
J3KRW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
J3KRW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
J3KRW8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3KRW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
J3KRW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
J3KRW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3KRW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3KRW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3KRW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3KRW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3KRW8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3KRW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
J3KRW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3KRW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3KRW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3KRW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
J3KRW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3KRW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
J3KRW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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