Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX16-NPEPL1H3BU86 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX16-NPEPL1H3BU86 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STX16-NPEPL1H3BU86 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STX16-NPEPL1H3BU86 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STX16-NPEPL1H3BU86 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STX16-NPEPL1H3BU86 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms