Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPL8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A1W2PPL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PPL8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PPL8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PPL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PPL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms