Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPL8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPL8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
A0A1W2PPL8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
A0A1W2PPL8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
A0A1W2PPL8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A1W2PPL8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A1W2PPL8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A1W2PPL8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A1W2PPL8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A0A1W2PPL8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
A0A1W2PPL8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
A0A1W2PPL8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A1W2PPL8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A1W2PPL8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
A0A1W2PPL8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A1W2PPL8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1W2PPL8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A1W2PPL8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1W2PPL8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1W2PPL8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PPL8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1W2PPL8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1W2PPL8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1W2PPL8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1W2PPL8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1W2PPL8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1W2PPL8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1W2PPL8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1W2PPL8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A1W2PPL8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A1W2PPL8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A1W2PPL8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
A0A1W2PPL8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A1W2PPL8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A1W2PPL8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A1W2PPL8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A1W2PPL8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A1W2PPL8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A1W2PPL8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
A0A1W2PPL8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A1W2PPL8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A1W2PPL8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A1W2PPL8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A1W2PPL8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A1W2PPL8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A1W2PPL8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A1W2PPL8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A1W2PPL8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A1W2PPL8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1W2PPL8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1W2PPL8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1W2PPL8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1W2PPL8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A1W2PPL8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A1W2PPL8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A1W2PPL8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A1W2PPL8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A1W2PPL8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A1W2PPL8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A1W2PPL8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A1W2PPL8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A1W2PPL8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A1W2PPL8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A1W2PPL8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A1W2PPL8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PPL8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A1W2PPL8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A1W2PPL8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A1W2PPL8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A1W2PPL8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A1W2PPL8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A1W2PPL8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A1W2PPL8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A1W2PPL8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A1W2PPL8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PPL8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PPL8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PPL8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PPL8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PPL8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1W2PPL8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A1W2PPL8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A1W2PPL8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A1W2PPL8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A1W2PPL8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A1W2PPL8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A1W2PPL8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
A0A1W2PPL8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2PPL8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2PPL8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPL8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2PPL8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2PPL8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2PPL8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PPL8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PPL8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PPL8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PPL8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2PPL8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PPL8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PPL8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms