Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LYVE1Q9Y5Y7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYVE1Q9Y5Y7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LYVE1Q9Y5Y7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LYVE1Q9Y5Y7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYVE1Q9Y5Y7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYVE1Q9Y5Y7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYVE1Q9Y5Y7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYVE1Q9Y5Y7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms