Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW0

FOXJ3, Forkhead box protein J3, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ3Q9UPW0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXJ3Q9UPW0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXJ3Q9UPW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXJ3Q9UPW0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXJ3Q9UPW0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXJ3Q9UPW0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXJ3Q9UPW0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXJ3Q9UPW0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXJ3Q9UPW0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXJ3Q9UPW0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXJ3Q9UPW0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXJ3Q9UPW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXJ3Q9UPW0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXJ3Q9UPW0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms