Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CWC15Q9P013 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC15Q9P013 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC15Q9P013 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC15Q9P013 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CWC15Q9P013 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CWC15Q9P013 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CWC15Q9P013 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CWC15Q9P013 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CWC15Q9P013 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CWC15Q9P013 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CWC15Q9P013 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CWC15Q9P013 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CWC15Q9P013 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CWC15Q9P013 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CWC15Q9P013 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CWC15Q9P013 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC15Q9P013 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CWC15Q9P013 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC15Q9P013 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC15Q9P013 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CWC15Q9P013 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CWC15Q9P013 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CWC15Q9P013 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC15Q9P013 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC15Q9P013 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC15Q9P013 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC15Q9P013 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC15Q9P013 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms