Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT84Q9NSB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT84Q9NSB2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT84Q9NSB2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT84Q9NSB2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT84Q9NSB2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT84Q9NSB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT84Q9NSB2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT84Q9NSB2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT84Q9NSB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT84Q9NSB2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT84Q9NSB2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT84Q9NSB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT84Q9NSB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms