Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX15Q9NRS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX15Q9NRS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX15Q9NRS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX15Q9NRS6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX15Q9NRS6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX15Q9NRS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX15Q9NRS6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX15Q9NRS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX15Q9NRS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX15Q9NRS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX15Q9NRS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX15Q9NRS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX15Q9NRS6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX15Q9NRS6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX15Q9NRS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX15Q9NRS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX15Q9NRS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms