Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
UPF2Q9HAU5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
UPF2Q9HAU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
UPF2Q9HAU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
UPF2Q9HAU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
UPF2Q9HAU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
UPF2Q9HAU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
UPF2Q9HAU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
UPF2Q9HAU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
UPF2Q9HAU5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
UPF2Q9HAU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
UPF2Q9HAU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
UPF2Q9HAU5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
UPF2Q9HAU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
UPF2Q9HAU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
UPF2Q9HAU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
UPF2Q9HAU5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
UPF2Q9HAU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
UPF2Q9HAU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
UPF2Q9HAU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
UPF2Q9HAU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
UPF2Q9HAU5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
UPF2Q9HAU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UPF2Q9HAU5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms