Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9H4

VPS37B, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37BQ9H9H4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37BQ9H9H4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37BQ9H9H4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS37BQ9H9H4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37BQ9H9H4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37BQ9H9H4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS37BQ9H9H4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37BQ9H9H4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37BQ9H9H4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37BQ9H9H4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms