Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPAS2Q99743 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPAS2Q99743 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPAS2Q99743 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPAS2Q99743 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NPAS2Q99743 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPAS2Q99743 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPAS2Q99743 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPAS2Q99743 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NPAS2Q99743 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms