Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf49Q96NF6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf49Q96NF6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C8orf49Q96NF6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C8orf49Q96NF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C8orf49Q96NF6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf49Q96NF6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf49Q96NF6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf49Q96NF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf49Q96NF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf49Q96NF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms