Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3CQ96E17 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3CQ96E17 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3CQ96E17 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3CQ96E17 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3CQ96E17 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3CQ96E17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB3CQ96E17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms