Protein–RNA interactions for Protein: Q96A46

SLC25A28, Mitoferrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A28Q96A46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A28Q96A46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A28Q96A46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A28Q96A46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A28Q96A46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A28Q96A46 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC25A28Q96A46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC25A28Q96A46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A28Q96A46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A28Q96A46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A28Q96A46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A28Q96A46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A28Q96A46 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms