Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFFLQ8WZ73 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFFLQ8WZ73 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RFFLQ8WZ73 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RFFLQ8WZ73 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RFFLQ8WZ73 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFFLQ8WZ73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFFLQ8WZ73 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFFLQ8WZ73 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFFLQ8WZ73 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFFLQ8WZ73 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFFLQ8WZ73 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RFFLQ8WZ73 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RFFLQ8WZ73 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RFFLQ8WZ73 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFFLQ8WZ73 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFFLQ8WZ73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 717 ms