Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8B7

TCEANC, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEANCQ8N8B7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEANCQ8N8B7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEANCQ8N8B7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEANCQ8N8B7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEANCQ8N8B7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEANCQ8N8B7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEANCQ8N8B7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEANCQ8N8B7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCEANCQ8N8B7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEANCQ8N8B7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEANCQ8N8B7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEANCQ8N8B7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCEANCQ8N8B7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCEANCQ8N8B7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms