Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGDCC3Q8IVU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC3Q8IVU1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC3Q8IVU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGDCC3Q8IVU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGDCC3Q8IVU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGDCC3Q8IVU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IGDCC3Q8IVU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGDCC3Q8IVU1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGDCC3Q8IVU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms