Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CACNA2D4Q7Z3S7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CACNA2D4Q7Z3S7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CACNA2D4Q7Z3S7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA2D4Q7Z3S7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CACNA2D4Q7Z3S7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CACNA2D4Q7Z3S7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms