Protein–RNA interactions for Protein: Q75T13

PGAP1, GPI inositol-deacylase, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP1Q75T13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAP1Q75T13 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGAP1Q75T13 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGAP1Q75T13 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGAP1Q75T13 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP1Q75T13 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGAP1Q75T13 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAP1Q75T13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAP1Q75T13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAP1Q75T13 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms