Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf116Q5BN46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf116Q5BN46 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf116Q5BN46 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf116Q5BN46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf116Q5BN46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf116Q5BN46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms