Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UVSSAQ2YD98 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UVSSAQ2YD98 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UVSSAQ2YD98 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
UVSSAQ2YD98 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
UVSSAQ2YD98 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
UVSSAQ2YD98 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UVSSAQ2YD98 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UVSSAQ2YD98 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
UVSSAQ2YD98 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UVSSAQ2YD98 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UVSSAQ2YD98 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UVSSAQ2YD98 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UVSSAQ2YD98 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
UVSSAQ2YD98 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UVSSAQ2YD98 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UVSSAQ2YD98 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UVSSAQ2YD98 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UVSSAQ2YD98 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UVSSAQ2YD98 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UVSSAQ2YD98 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UVSSAQ2YD98 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UVSSAQ2YD98 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UVSSAQ2YD98 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UVSSAQ2YD98 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UVSSAQ2YD98 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UVSSAQ2YD98 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UVSSAQ2YD98 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UVSSAQ2YD98 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UVSSAQ2YD98 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UVSSAQ2YD98 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UVSSAQ2YD98 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UVSSAQ2YD98 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UVSSAQ2YD98 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UVSSAQ2YD98 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UVSSAQ2YD98 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UVSSAQ2YD98 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
UVSSAQ2YD98 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UVSSAQ2YD98 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms