Protein–RNA interactions for Protein: Q17RR3

PNLIPRP3, Pancreatic lipase-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLIPRP3Q17RR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNLIPRP3Q17RR3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNLIPRP3Q17RR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNLIPRP3Q17RR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNLIPRP3Q17RR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNLIPRP3Q17RR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNLIPRP3Q17RR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNLIPRP3Q17RR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNLIPRP3Q17RR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNLIPRP3Q17RR3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms