Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11BQ15907 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11BQ15907 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB11BQ15907 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11BQ15907 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11BQ15907 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB11BQ15907 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11BQ15907 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11BQ15907 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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