Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERPUD1Q15011 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD1Q15011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HERPUD1Q15011 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERPUD1Q15011 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERPUD1Q15011 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERPUD1Q15011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERPUD1Q15011 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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