Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX1Q13596 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX1Q13596 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX1Q13596 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX1Q13596 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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SNX1Q13596 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX1Q13596 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX1Q13596 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX1Q13596 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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