Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GAB1Q13480 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GAB1Q13480 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GAB1Q13480 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GAB1Q13480 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAB1Q13480 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GAB1Q13480 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GAB1Q13480 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAB1Q13480 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GAB1Q13480 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GAB1Q13480 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GAB1Q13480 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GAB1Q13480 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAB1Q13480 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAB1Q13480 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms