Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF90Q03938 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF90Q03938 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF90Q03938 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF90Q03938 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF90Q03938 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF90Q03938 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF90Q03938 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF90Q03938 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF90Q03938 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF90Q03938 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF90Q03938 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF90Q03938 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF90Q03938 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF90Q03938 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF90Q03938 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF90Q03938 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF90Q03938 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF90Q03938 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.8 ms