Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IST1P53990 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IST1P53990 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IST1P53990 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IST1P53990 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IST1P53990 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IST1P53990 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IST1P53990 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IST1P53990 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IST1P53990 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IST1P53990 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IST1P53990 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IST1P53990 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IST1P53990 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IST1P53990 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IST1P53990 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IST1P53990 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IST1P53990 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IST1P53990 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IST1P53990 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IST1P53990 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IST1P53990 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IST1P53990 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IST1P53990 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IST1P53990 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IST1P53990 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IST1P53990 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IST1P53990 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IST1P53990 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IST1P53990 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IST1P53990 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IST1P53990 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IST1P53990 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IST1P53990 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IST1P53990 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IST1P53990 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IST1P53990 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IST1P53990 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IST1P53990 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IST1P53990 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IST1P53990 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IST1P53990 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IST1P53990 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IST1P53990 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IST1P53990 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IST1P53990 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IST1P53990 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IST1P53990 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IST1P53990 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IST1P53990 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IST1P53990 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IST1P53990 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IST1P53990 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IST1P53990 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IST1P53990 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IST1P53990 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IST1P53990 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IST1P53990 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IST1P53990 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IST1P53990 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IST1P53990 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IST1P53990 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IST1P53990 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IST1P53990 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IST1P53990 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IST1P53990 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IST1P53990 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IST1P53990 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IST1P53990 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IST1P53990 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IST1P53990 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IST1P53990 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IST1P53990 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IST1P53990 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IST1P53990 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IST1P53990 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IST1P53990 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IST1P53990 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IST1P53990 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IST1P53990 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IST1P53990 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IST1P53990 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IST1P53990 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IST1P53990 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IST1P53990 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IST1P53990 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IST1P53990 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IST1P53990 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IST1P53990 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IST1P53990 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IST1P53990 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IST1P53990 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IST1P53990 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IST1P53990 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IST1P53990 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IST1P53990 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IST1P53990 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IST1P53990 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IST1P53990 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IST1P53990 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms