Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX2P52951 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBX2P52951 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX2P52951 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX2P52951 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX2P52951 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX2P52951 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX2P52951 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX2P52951 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX2P52951 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX2P52951 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX2P52951 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX2P52951 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX2P52951 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX2P52951 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX2P52951 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX2P52951 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX2P52951 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX2P52951 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBX2P52951 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBX2P52951 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBX2P52951 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBX2P52951 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBX2P52951 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX2P52951 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX2P52951 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX2P52951 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX2P52951 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX2P52951 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX2P52951 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX2P52951 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX2P52951 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBX2P52951 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX2P52951 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX2P52951 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX2P52951 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX2P52951 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX2P52951 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX2P52951 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBX2P52951 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBX2P52951 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX2P52951 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX2P52951 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX2P52951 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX2P52951 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX2P52951 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX2P52951 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBX2P52951 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBX2P52951 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBX2P52951 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX2P52951 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX2P52951 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX2P52951 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBX2P52951 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBX2P52951 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX2P52951 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX2P52951 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX2P52951 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX2P52951 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX2P52951 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX2P52951 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX2P52951 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX2P52951 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBX2P52951 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBX2P52951 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBX2P52951 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBX2P52951 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GBX2P52951 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBX2P52951 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBX2P52951 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBX2P52951 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBX2P52951 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBX2P52951 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBX2P52951 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBX2P52951 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBX2P52951 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GBX2P52951 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBX2P52951 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBX2P52951 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBX2P52951 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBX2P52951 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBX2P52951 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBX2P52951 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBX2P52951 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBX2P52951 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBX2P52951 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBX2P52951 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBX2P52951 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBX2P52951 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBX2P52951 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBX2P52951 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBX2P52951 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBX2P52951 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBX2P52951 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBX2P52951 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBX2P52951 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBX2P52951 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBX2P52951 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBX2P52951 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBX2P52951 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms