Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOP2P46087 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOP2P46087 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOP2P46087 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP2P46087 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP2P46087 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP2P46087 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP2P46087 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP2P46087 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP2P46087 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP2P46087 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOP2P46087 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP2P46087 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOP2P46087 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP2P46087 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOP2P46087 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP2P46087 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP2P46087 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP2P46087 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP2P46087 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP2P46087 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP2P46087 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP2P46087 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP2P46087 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP2P46087 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP2P46087 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP2P46087 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP2P46087 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP2P46087 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP2P46087 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP2P46087 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP2P46087 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP2P46087 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP2P46087 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOP2P46087 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP2P46087 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP2P46087 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP2P46087 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP2P46087 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP2P46087 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP2P46087 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP2P46087 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP2P46087 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP2P46087 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP2P46087 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP2P46087 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP2P46087 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP2P46087 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP2P46087 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP2P46087 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP2P46087 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP2P46087 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP2P46087 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP2P46087 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP2P46087 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP2P46087 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP2P46087 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP2P46087 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP2P46087 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP2P46087 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP2P46087 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOP2P46087 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms