Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT15P19012 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT15P19012 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT15P19012 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT15P19012 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT15P19012 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT15P19012 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT15P19012 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT15P19012 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT15P19012 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT15P19012 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT15P19012 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT15P19012 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT15P19012 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT15P19012 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT15P19012 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT15P19012 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT15P19012 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT15P19012 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT15P19012 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT15P19012 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT15P19012 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT15P19012 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT15P19012 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT15P19012 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT15P19012 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT15P19012 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT15P19012 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT15P19012 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT15P19012 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT15P19012 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT15P19012 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT15P19012 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT15P19012 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT15P19012 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT15P19012 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT15P19012 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT15P19012 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT15P19012 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT15P19012 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT15P19012 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT15P19012 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT15P19012 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT15P19012 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT15P19012 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT15P19012 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT15P19012 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT15P19012 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT15P19012 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT15P19012 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT15P19012 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT15P19012 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT15P19012 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT15P19012 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT15P19012 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT15P19012 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT15P19012 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT15P19012 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT15P19012 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT15P19012 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT15P19012 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT15P19012 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT15P19012 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT15P19012 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT15P19012 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT15P19012 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT15P19012 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT15P19012 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT15P19012 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT15P19012 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT15P19012 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT15P19012 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT15P19012 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT15P19012 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT15P19012 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT15P19012 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT15P19012 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT15P19012 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT15P19012 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT15P19012 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT15P19012 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT15P19012 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT15P19012 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT15P19012 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT15P19012 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT15P19012 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT15P19012 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT15P19012 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT15P19012 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT15P19012 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT15P19012 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT15P19012 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT15P19012 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT15P19012 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT15P19012 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT15P19012 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT15P19012 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT15P19012 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT15P19012 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT15P19012 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms