Protein–RNA interactions for Protein: P16519

PCSK2, Neuroendocrine convertase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK2P16519 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK2P16519 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK2P16519 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCSK2P16519 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCSK2P16519 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCSK2P16519 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCSK2P16519 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK2P16519 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK2P16519 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK2P16519 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK2P16519 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK2P16519 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK2P16519 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK2P16519 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms