Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB1

PRR23D2, Proline-rich protein 23D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23D2P0DMB1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR23D2P0DMB1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR23D2P0DMB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRR23D2P0DMB1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRR23D2P0DMB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRR23D2P0DMB1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRR23D2P0DMB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRR23D2P0DMB1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR23D2P0DMB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR23D2P0DMB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRR23D2P0DMB1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms