Protein–RNA interactions for Protein: P0CG48

UBC, Polyubiquitin-C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBCP0CG48 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBCP0CG48 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBCP0CG48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBCP0CG48 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBCP0CG48 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBCP0CG48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBCP0CG48 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBCP0CG48 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBCP0CG48 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBCP0CG48 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBCP0CG48 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms