Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00869P0C866 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00869P0C866 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00869P0C866 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00869P0C866 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00869P0C866 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00869P0C866 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00869P0C866 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00869P0C866 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00869P0C866 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00869P0C866 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00869P0C866 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00869P0C866 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00869P0C866 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00869P0C866 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00869P0C866 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00869P0C866 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00869P0C866 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00869P0C866 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00869P0C866 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00869P0C866 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00869P0C866 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00869P0C866 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00869P0C866 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00869P0C866 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00869P0C866 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 543.5 ms