Protein–RNA interactions for Protein: P08887

IL6R, Interleukin-6 receptor subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6RP08887 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IL6RP08887 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IL6RP08887 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IL6RP08887 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IL6RP08887 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IL6RP08887 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IL6RP08887 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IL6RP08887 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL6RP08887 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL6RP08887 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL6RP08887 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IL6RP08887 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL6RP08887 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL6RP08887 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL6RP08887 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL6RP08887 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL6RP08887 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL6RP08887 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL6RP08887 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL6RP08887 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL6RP08887 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL6RP08887 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL6RP08887 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IL6RP08887 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL6RP08887 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL6RP08887 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL6RP08887 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL6RP08887 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL6RP08887 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL6RP08887 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL6RP08887 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL6RP08887 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL6RP08887 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL6RP08887 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL6RP08887 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL6RP08887 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL6RP08887 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL6RP08887 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IL6RP08887 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL6RP08887 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL6RP08887 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IL6RP08887 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL6RP08887 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IL6RP08887 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL6RP08887 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL6RP08887 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL6RP08887 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL6RP08887 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IL6RP08887 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL6RP08887 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IL6RP08887 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL6RP08887 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL6RP08887 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IL6RP08887 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL6RP08887 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL6RP08887 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL6RP08887 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL6RP08887 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL6RP08887 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IL6RP08887 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL6RP08887 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL6RP08887 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL6RP08887 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IL6RP08887 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL6RP08887 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6RP08887 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6RP08887 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6RP08887 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6RP08887 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IL6RP08887 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IL6RP08887 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6RP08887 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6RP08887 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6RP08887 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6RP08887 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6RP08887 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6RP08887 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6RP08887 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6RP08887 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6RP08887 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6RP08887 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6RP08887 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6RP08887 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6RP08887 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6RP08887 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6RP08887 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6RP08887 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6RP08887 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6RP08887 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6RP08887 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6RP08887 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6RP08887 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6RP08887 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL6RP08887 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL6RP08887 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IL6RP08887 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL6RP08887 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL6RP08887 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IL6RP08887 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL6RP08887 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms