Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APOA4P06727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APOA4P06727 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA4P06727 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APOA4P06727 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOA4P06727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOA4P06727 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOA4P06727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APOA4P06727 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA4P06727 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APOA4P06727 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOA4P06727 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
APOA4P06727 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOA4P06727 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOA4P06727 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOA4P06727 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOA4P06727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA4P06727 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOA4P06727 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA4P06727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA4P06727 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOA4P06727 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOA4P06727 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOA4P06727 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
APOA4P06727 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA4P06727 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA4P06727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOA4P06727 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOA4P06727 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
APOA4P06727 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOA4P06727 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA4P06727 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOA4P06727 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA4P06727 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA4P06727 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOA4P06727 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOA4P06727 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA4P06727 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOA4P06727 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA4P06727 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA4P06727 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOA4P06727 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA4P06727 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOA4P06727 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOA4P06727 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA4P06727 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOA4P06727 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA4P06727 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOA4P06727 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOA4P06727 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOA4P06727 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA4P06727 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA4P06727 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
APOA4P06727 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA4P06727 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA4P06727 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA4P06727 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA4P06727 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOA4P06727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA4P06727 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA4P06727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOA4P06727 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOA4P06727 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
APOA4P06727 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
APOA4P06727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA4P06727 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOA4P06727 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA4P06727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA4P06727 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA4P06727 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOA4P06727 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA4P06727 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOA4P06727 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA4P06727 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOA4P06727 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA4P06727 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA4P06727 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOA4P06727 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA4P06727 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOA4P06727 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA4P06727 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOA4P06727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA4P06727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOA4P06727 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA4P06727 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA4P06727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA4P06727 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA4P06727 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOA4P06727 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOA4P06727 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOA4P06727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOA4P06727 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA4P06727 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
APOA4P06727 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOA4P06727 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA4P06727 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOA4P06727 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA4P06727 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA4P06727 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOA4P06727 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms