Protein–RNA interactions for Protein: P05814

CSN2, Beta-casein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN2P05814 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSN2P05814 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSN2P05814 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSN2P05814 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSN2P05814 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSN2P05814 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSN2P05814 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSN2P05814 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSN2P05814 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSN2P05814 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSN2P05814 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSN2P05814 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSN2P05814 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSN2P05814 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSN2P05814 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSN2P05814 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSN2P05814 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSN2P05814 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSN2P05814 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSN2P05814 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSN2P05814 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSN2P05814 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSN2P05814 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSN2P05814 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSN2P05814 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSN2P05814 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSN2P05814 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSN2P05814 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSN2P05814 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSN2P05814 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSN2P05814 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSN2P05814 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSN2P05814 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSN2P05814 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSN2P05814 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSN2P05814 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSN2P05814 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSN2P05814 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSN2P05814 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSN2P05814 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSN2P05814 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSN2P05814 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSN2P05814 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSN2P05814 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSN2P05814 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSN2P05814 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSN2P05814 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSN2P05814 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSN2P05814 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSN2P05814 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSN2P05814 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSN2P05814 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSN2P05814 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSN2P05814 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSN2P05814 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSN2P05814 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSN2P05814 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSN2P05814 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSN2P05814 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSN2P05814 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSN2P05814 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSN2P05814 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSN2P05814 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSN2P05814 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSN2P05814 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSN2P05814 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSN2P05814 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSN2P05814 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSN2P05814 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSN2P05814 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSN2P05814 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSN2P05814 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSN2P05814 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSN2P05814 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSN2P05814 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSN2P05814 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSN2P05814 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSN2P05814 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSN2P05814 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSN2P05814 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSN2P05814 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSN2P05814 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSN2P05814 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSN2P05814 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSN2P05814 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSN2P05814 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSN2P05814 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSN2P05814 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSN2P05814 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSN2P05814 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSN2P05814 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSN2P05814 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSN2P05814 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSN2P05814 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSN2P05814 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSN2P05814 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSN2P05814 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSN2P05814 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSN2P05814 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSN2P05814 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms