Protein–RNA interactions for Protein: P05814

CSN2, Beta-casein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN2P05814 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CSN2P05814 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSN2P05814 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSN2P05814 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSN2P05814 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSN2P05814 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CSN2P05814 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSN2P05814 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSN2P05814 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSN2P05814 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSN2P05814 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSN2P05814 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSN2P05814 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSN2P05814 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSN2P05814 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSN2P05814 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSN2P05814 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSN2P05814 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSN2P05814 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSN2P05814 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSN2P05814 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSN2P05814 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSN2P05814 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSN2P05814 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSN2P05814 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSN2P05814 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSN2P05814 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSN2P05814 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSN2P05814 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSN2P05814 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSN2P05814 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSN2P05814 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSN2P05814 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSN2P05814 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSN2P05814 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSN2P05814 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSN2P05814 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSN2P05814 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSN2P05814 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSN2P05814 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSN2P05814 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSN2P05814 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSN2P05814 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSN2P05814 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSN2P05814 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSN2P05814 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSN2P05814 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSN2P05814 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSN2P05814 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSN2P05814 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSN2P05814 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSN2P05814 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSN2P05814 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSN2P05814 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSN2P05814 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSN2P05814 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSN2P05814 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSN2P05814 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSN2P05814 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSN2P05814 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSN2P05814 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSN2P05814 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSN2P05814 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSN2P05814 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSN2P05814 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSN2P05814 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSN2P05814 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSN2P05814 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSN2P05814 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSN2P05814 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSN2P05814 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSN2P05814 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSN2P05814 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSN2P05814 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSN2P05814 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSN2P05814 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSN2P05814 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSN2P05814 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSN2P05814 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSN2P05814 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSN2P05814 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSN2P05814 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSN2P05814 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSN2P05814 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSN2P05814 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSN2P05814 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSN2P05814 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSN2P05814 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSN2P05814 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSN2P05814 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSN2P05814 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSN2P05814 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSN2P05814 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSN2P05814 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSN2P05814 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSN2P05814 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSN2P05814 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSN2P05814 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSN2P05814 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSN2P05814 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms