Protein–RNA interactions for Protein: P05013

IFNA6, Interferon alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA6P05013 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNA6P05013 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA6P05013 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA6P05013 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNA6P05013 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNA6P05013 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNA6P05013 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNA6P05013 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA6P05013 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA6P05013 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNA6P05013 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNA6P05013 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNA6P05013 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNA6P05013 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNA6P05013 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA6P05013 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms