Protein–RNA interactions for Protein: P01763

IGHV3-48, Immunoglobulin heavy variable 3-48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-48P01763 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-48P01763 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV3-48P01763 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-48P01763 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IGHV3-48P01763 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHV3-48P01763 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHV3-48P01763 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms