Protein–RNA interactions for Protein: P01763

IGHV3-48, Immunoglobulin heavy variable 3-48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-48P01763 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGHV3-48P01763 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGHV3-48P01763 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHV3-48P01763 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IGHV3-48P01763 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGHV3-48P01763 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGHV3-48P01763 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHV3-48P01763 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHV3-48P01763 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHV3-48P01763 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-48P01763 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGHV3-48P01763 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGHV3-48P01763 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGHV3-48P01763 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGHV3-48P01763 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHV3-48P01763 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGHV3-48P01763 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGHV3-48P01763 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-48P01763 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHV3-48P01763 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHV3-48P01763 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGHV3-48P01763 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHV3-48P01763 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHV3-48P01763 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGHV3-48P01763 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-48P01763 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-48P01763 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-48P01763 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-48P01763 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-48P01763 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-48P01763 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-48P01763 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-48P01763 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-48P01763 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-48P01763 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-48P01763 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHV3-48P01763 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHV3-48P01763 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGHV3-48P01763 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHV3-48P01763 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHV3-48P01763 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHV3-48P01763 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGHV3-48P01763 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHV3-48P01763 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV3-48P01763 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-48P01763 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV3-48P01763 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV3-48P01763 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-48P01763 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-48P01763 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-48P01763 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-48P01763 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV3-48P01763 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-48P01763 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-48P01763 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-48P01763 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-48P01763 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV3-48P01763 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-48P01763 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-48P01763 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-48P01763 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-48P01763 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHV3-48P01763 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV3-48P01763 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-48P01763 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-48P01763 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-48P01763 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV3-48P01763 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHV3-48P01763 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHV3-48P01763 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGHV3-48P01763 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGHV3-48P01763 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGHV3-48P01763 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGHV3-48P01763 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV3-48P01763 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGHV3-48P01763 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IGHV3-48P01763 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGHV3-48P01763 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGHV3-48P01763 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-48P01763 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-48P01763 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-48P01763 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-48P01763 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHV3-48P01763 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHV3-48P01763 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-48P01763 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHV3-48P01763 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-48P01763 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHV3-48P01763 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHV3-48P01763 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-48P01763 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV3-48P01763 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-48P01763 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-48P01763 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-48P01763 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-48P01763 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-48P01763 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-48P01763 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-48P01763 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-48P01763 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms