Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IDH3BO43837 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH3BO43837 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IDH3BO43837 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IDH3BO43837 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IDH3BO43837 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IDH3BO43837 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IDH3BO43837 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IDH3BO43837 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms