Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIN7AO14910 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN7AO14910 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN7AO14910 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN7AO14910 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN7AO14910 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LIN7AO14910 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN7AO14910 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LIN7AO14910 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LIN7AO14910 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LIN7AO14910 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN7AO14910 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LIN7AO14910 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN7AO14910 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN7AO14910 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN7AO14910 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN7AO14910 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN7AO14910 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LIN7AO14910 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN7AO14910 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN7AO14910 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN7AO14910 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms