Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLOD2O00469 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLOD2O00469 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
PLOD2O00469 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLOD2O00469 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLOD2O00469 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLOD2O00469 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLOD2O00469 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLOD2O00469 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLOD2O00469 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLOD2O00469 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLOD2O00469 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PLOD2O00469 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms