Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UPK1AO00322 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UPK1AO00322 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPK1AO00322 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPK1AO00322 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK1AO00322 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UPK1AO00322 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UPK1AO00322 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UPK1AO00322 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms