Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
UPK1AO00322 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
UPK1AO00322 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
UPK1AO00322 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
UPK1AO00322 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
UPK1AO00322 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
UPK1AO00322 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UPK1AO00322 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UPK1AO00322 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UPK1AO00322 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UPK1AO00322 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UPK1AO00322 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UPK1AO00322 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
UPK1AO00322 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPK1AO00322 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPK1AO00322 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
UPK1AO00322 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UPK1AO00322 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPK1AO00322 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPK1AO00322 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UPK1AO00322 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UPK1AO00322 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPK1AO00322 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPK1AO00322 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UPK1AO00322 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UPK1AO00322 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UPK1AO00322 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPK1AO00322 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPK1AO00322 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UPK1AO00322 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UPK1AO00322 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UPK1AO00322 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPK1AO00322 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPK1AO00322 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPK1AO00322 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPK1AO00322 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPK1AO00322 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPK1AO00322 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPK1AO00322 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPK1AO00322 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPK1AO00322 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPK1AO00322 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPK1AO00322 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPK1AO00322 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPK1AO00322 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPK1AO00322 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UPK1AO00322 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UPK1AO00322 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UPK1AO00322 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UPK1AO00322 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UPK1AO00322 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPK1AO00322 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPK1AO00322 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPK1AO00322 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPK1AO00322 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPK1AO00322 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPK1AO00322 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPK1AO00322 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPK1AO00322 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPK1AO00322 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPK1AO00322 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPK1AO00322 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPK1AO00322 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPK1AO00322 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPK1AO00322 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UPK1AO00322 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPK1AO00322 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPK1AO00322 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPK1AO00322 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPK1AO00322 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPK1AO00322 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPK1AO00322 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPK1AO00322 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UPK1AO00322 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UPK1AO00322 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPK1AO00322 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UPK1AO00322 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPK1AO00322 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UPK1AO00322 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPK1AO00322 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPK1AO00322 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPK1AO00322 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK1AO00322 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK1AO00322 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPK1AO00322 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPK1AO00322 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPK1AO00322 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UPK1AO00322 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UPK1AO00322 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPK1AO00322 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPK1AO00322 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UPK1AO00322 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UPK1AO00322 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPK1AO00322 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UPK1AO00322 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UPK1AO00322 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPK1AO00322 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPK1AO00322 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UPK1AO00322 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPK1AO00322 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms