Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSMD12O00232 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD12O00232 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD12O00232 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSMD12O00232 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSMD12O00232 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMD12O00232 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD12O00232 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD12O00232 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms