Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
J3QLW9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QLW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QLW9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QLW9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
J3QLW9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QLW9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QLW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QLW9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QLW9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
J3QLW9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QLW9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
J3QLW9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
J3QLW9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QLW9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QLW9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QLW9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QLW9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
J3QLW9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
J3QLW9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
J3QLW9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3QLW9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
J3QLW9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QLW9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3QLW9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3QLW9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
J3QLW9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
J3QLW9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3QLW9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QLW9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QLW9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QLW9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QLW9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QLW9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QLW9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3QLW9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3QLW9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3QLW9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
J3QLW9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3QLW9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3QLW9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3QLW9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3QLW9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QLW9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QLW9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3QLW9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QLW9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QLW9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QLW9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QLW9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3QLW9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QLW9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QLW9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QLW9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3QLW9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3QLW9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3QLW9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3QLW9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3QLW9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3QLW9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QLW9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QLW9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
J3QLW9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QLW9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QLW9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3QLW9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3QLW9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3QLW9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3QLW9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QLW9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QLW9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QLW9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QLW9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QLW9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QLW9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3QLW9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
J3QLW9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3QLW9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3QLW9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3QLW9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3QLW9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3QLW9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
J3QLW9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QLW9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QLW9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QLW9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QLW9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QLW9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3QLW9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3QLW9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3QLW9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3QLW9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QLW9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
J3QLW9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QLW9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QLW9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
J3QLW9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
J3QLW9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3QLW9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
J3QLW9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms